Mercredi 25
Développements et applications des MPC

› 14:00 - 14:50 (50min)
APE, logiciel pour la phylogénétique et l'évolution: passé, présent et avenir
Emmanuel Paradis  1@  
1 : Institut des Sciences de lÉvolution [Montpellier]  (ISEM)  -  Site web
Université de Montpellier, Institut de recherche pour le développement [IRD] : UR226 : UR226, Centre National de la Recherche Scientifique : UMR5554
Place E. Bataillon CC 064 34095 Montpellier Cedex 05 -  France

Le logiciel ape (analysis of phylogenetics and evolution) a vu le jour en 2001 suite à un appel d'offres inter-EPST ``Bio-informatique''. La première version a été rendue publique le 27 août 2002. Depuis cette date, ape n'a cessé de croître par le nombre d'utilisateurs, le nombre de citations, la diversité des disciplines où il est utilisé, ainsi que par la quantité de fonctionnalités et de méthodes proposées aux utilisateurs. Cet exposé sera l'occasion de revenir sur quinze années de développement, de faire le bilan et l'état des lieux du statut de ape au sein de la communauté scientifique, et de dresser les perspectives de développement futurs. En accent particulier sera mis sur les méthodes comparatives phylogénétiques qui, il y a quinze ans, étaient une motivation forte dans la création et le développement de ape.


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